寧德市設9個縣（市）氣象局（臺、站），機構規(guī)格為正科級。其中福鼎、寧德、屏南、霞浦、壽寧5個為國家基本氣象站，由寧德市氣象局統(tǒng)一管理，設置在縣級行政區(qū)域的國家基本氣象站與所在行政區(qū)域的縣級氣象局實行局、站合一。福安、古田、周寧、柘榮4個為國家氣象觀測站，設置在縣級行政區(qū)域的國家氣象觀測站與所在行政區(qū)域的縣級氣象局實行局、站合一；三沙1個為國家氣象觀測站，以海洋觀測項目為主，為獨立科級單位。
寧德市氣象局內(nèi)設辦公室、業(yè)務科技科、政策法規(guī)科、人事教育科4個職能科（室）。寧德市氣象臺、寧德市防雷中心、寧德市氣象局科技服務中心、寧德市信息網(wǎng)絡與裝備保障中心4個直屬單位。截至2009年底，全市氣象部門在職人員總數(shù)138人，離退休51人。在職人員中，碩士2人，本科54人，大專52人；高級工程師6人，工程師54人，助理工程師68人。
