（一）內設機構
辦公室（計財處）、業(yè)務科技處、人事教育處、政策法規(guī)處
（二）直屬單位
福州市氣象臺、福州市氣象信息網(wǎng)絡與裝備保障中心、福州市氣象服務中心、福州農(nóng)業(yè)氣象試驗站（晉安區(qū)氣象局）、福州市財務核算中心、福州市氣象災害防御技術中心
（三）縣（市）區(qū)局
福建省福州市長樂區(qū)氣象局、福建省福清市氣象局、福建省閩侯縣氣象局、福建省連江縣氣象局、福建省羅源縣氣象局、福建省閩清縣氣象局、福建省永泰縣氣象局、福建省福州市氣象局馬尾氣象分局
